Видимо, прионы имеют естественное происхождение. Прионы могли первоначально появиться либо во время ошибочной модификации белка с нормальной формой. В итоге появляется один прионный белок, который начинает превращать другие белки с нормальной формой в белки с прионной формой. Далее прионы – белки с прионной формой попали в другие клетки, а далее и в другие организмы, увеличиваясь в количестве. Второй вариант возникновения прионов – мутации в генетическом коде, в результате которых ошибка в генетической информации может передаваться потомкам организма. Суть мутации – в результате ошибки в генетическом коде, будет формироваться не нормальный белок, а прионный белок. Либо будет формироваться нормальный белок с повышенной вероятностью перехода в прионную форму. Разные разновидности прионов не имеют общего происхождения. В отличия от всех клеточных организмов которые все произошли от одного организма. Отдельно появились прионы вызывающие коровье бешенство. Отдельно от них появились прионы вызывающие болезнь куру.